โรงเรียนบ้านน้ำดำ เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษา สังกัดสำนักเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาปัตตานี เขต 3 จัดการเรียนการสอนในระดับชั้นอนุบาล 1 ถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 มีผู้เรียน จำนวน 198 คน มีครูและบุคลากร รวม 29 คนดังนี้ ผู้อำนวยการโรงเรียน 1 คน  ข้าราชการครู 16 คน พนักงานราชการ 4 คน อัตราจ้างครูอิสลาม 5 คน เจ้าหน้าที่ธุรการ 1 คน นักการภารโรง 3 คน ปัจจุบันมี นางฮายาตี ดะแซ ดำรงตำแหน่ง ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านน้ำดำ